viernes, 4 de marzo de 2011

Del diseño a la RuBisco


En el mundo del pensamiento complejo, aceptar que el genoma humano es, por mucho, menor que el de una planta, es un paso para derrocar los males de la humanidad. ¿Qué tan importante es considerar las características enigmáticas que encierra la naturaleza? ¨Si un chango aprende a decir depende, automáticamente es un biólogo¨, y habiendo tanto chango intelectual, el requisito no termina de cumplirse. El enigmático mundo biológico, juguetea con las leyes físicas y químicas, ajustándolas al ¨capricho¨ de existir. Sin tratar de extenderme en la cuestión, para mis propios fines educativos desecharé de mi vocabulario cualquier afinidad con el término que sugiere un arreglo intelectual, a no ser por las propias manos del hombre en la construcción inteligente para todo un mundo de posibilidades tecnológicas. El límite que justifica nuestros ataques contra el relojero o director de orquesta está inflándose de ideas que abusan de las características propias del no sentido estricto. Existen grandes muchos ejemplos de los ¨fallos¨ del diseño inteligente que erróneamente defiende la tendencia hacía una mejora, y es indiscutible que negar el determinismo puntual y otras imposturas sean tan incorrectas como correctas. Los extremos, bien decía mi abuela, no son buenos y estos han abusado considerablemente en todo intento por darle un carácter de molde a la ciencia. Tras mi última práctica de laboratorio en la semana, recordé las inmortales palabras de nuestra maestra de fisiología vegetal, en la que tras su característica excitación por el tema, mencionó que si existía Dios, seguramente era la Rubisco. La importancia colosal de la Rubisco es que es la proteína más abundante de todo nuestro planeta y el primer paso para la fotosíntesis en la gran mayoría de las plantas (C3 y C4). La enzima rubisco tiene dos actividades paralelas: la carboxilación y por otro lado la oxigenación de la ribulosa-1,5- bifosfato (RuBP). Esta competencia de afinidad, es la razón por la cual algunos aseguran que es un válido ejemplo de ¨fallo¨en la naturaleza. A mediados del siglo XX, Melvin Calvin (Nobel de Química en 1961), describió la ruta por la cual la energía química en forma de ATP y NADPH, conseguida a partir de la energía lumínica, se utiliza, entre otros procesos, para fijar el Carbono procedente del CO2 atmosférico en compuestos orgánicos. Y es aquí donde la protagonista es nuestra Rubisco. En la competencia por afinidad, la fijación del oxígeno se entiende, malamente, como un desperdicio de energía, (la fotorrespiración).

La fotorrespiración es un error, un fallo, las plantas la realizan sin quererlo. El fallo por lo tanto es la baja selectividad de la RuBisCo que le permite reaccionar tanto con el CO2 como con el O2, cuando lo ideal sería que sólo reaccionara con el CO2. En una situación típica, la fotorrespiración reduce la eficiencia del proceso a un 70%. Para los biólogos, acostumbrados a mecanismos de regulación prácticamente perfectos, esta eficiencia tan baja es totalmente anormal, y es por eso que se considera un probable fallo en la evolución.

Afirmar que la Rubisco es un buen ejemplo de fallo en el diseño, es una aseveración que bien debería anularse. Las condiciones en las que se originó la Rubisco, ciertamente eran distintas a las que existen en la actualidad, motivo por el cual, la idea de un simple fallo del diseñador ¨perfecto¨, es un error. La baja eficiencia no representa una cuestión anormal para un biólogo, pues los procesos que considera la evolución no ven a futuro, pues no toda evolución es adaptativa, ni toda adaptación representa evolución. La función de la fotorrespiración aún es desconocida, se piensa que podría ser útil en condiciones de intensa luz y bajas concentraciones de CO2 debidas al cierre estomático persistente, causado por estrés hídrico. También se cree que podría tener un papel importante en la prevención de la fotooxidación y la fotoinhibición.

La única mano de obra ¨inteligente¨ es la mano del hombre en su afán por regular la naturaleza, ¨…su fracaso en adaptarse de manera significativa a la atmósfera moderna limita la productividad agrícola.¨ John Ellis, Nature.

Las ¨fallas¨ están en función de la utilidad, pero, el depende determina la efectividad significativa; Entre las curiosidades de Rubisco, Griffiths, encontró que , a una temperatura de 25ºC en una solución en la que hay 25 veces más oxígeno que dióxido de carbono, Rubisco fija más dióxido de carbono, y tan sólo el 25% de las reacciones son sucesos de oxigenasa, además los carbonos perdidos por la acción de oxigenasa, son metabolizados y recuperados por la ruta de fotorrespiración. La baja eficiencia que representa la Rubisco es compensado con su cantidad, que representa aproximadamente el 50% de proteína soluble en la hoja. La oxigenación evita la fijación de CO2 y disminuye el rendimiento de la fotosíntesis, pero parte del CO2 perdido se recupera por el mecanismo de la fotorrespiración. Se debate que la posibilidad de que pueda haber una adaptación casi óptima a los medios gaseosos y térmicos, prueba de ello, las modificaciones de las rutas en las plantas condicionadas a ambientes difíciles.

La crítica al verdadero diseño inteligente:

El mayor de los misterios es por qué personas invierten tanta energía intelectual tratando de mejorar esta extraordinaria molécula. Pueden vivir con el pensamiento de que la Rubisco es un soberbio ejemplo de un diseño sin inteligencia para el mundo moderno. Tacking unintelligent designin.

sábado, 19 de febrero de 2011

El conocimiento es un asunto peligroso

Hoy el título de la presente entrada me parece una ilusión, un sueño carente de sentido que parte de una idea tan errónea como fantasiosa. En cierto momento despertaré, o bien, nos podremos hundir todos juntos en éste. El título es tomado de una de las celebres reflexiones de Alexander Pope, quién manifiesta la observación del conocimiento peligroso y, aunque mi conocimiento sobre éste es nulo, (ya saben, para mantenerme a salvo (;), algunos grandes afirman que aunque es una buena observación, el aforismo no resiste aislado de su contexto.

Un poco de conocimiento es un asunto peligroso; beba profundamente de la fuente de Pieria o no beba nada. Porque allí, solamente sorbiendo un poco, intoxica el cerebro, mientras que bebiendo mucho nos devuelva la sobriedad. Un ensayo sobre la crítica.

Suena bastante peligroso intoxicar el cerebro, pero, para qué pecar con poblar la mente de ideas a medio formar.¿Quién no ha pasado por el rollo largo de algunos grupos privilegiados con la mano de Dios, para instruir a la sociedad y en particular a los jóvenes con la creencia de que el saber crítico es un asunto de perversión?. Cuando toquen a mi puerta sacaré mi mejor tarjeta de presentación: ¨Nunca enseñé a un tonto un trabajo hecho a medias¨. Si se nos ocurre pensar detenidamente en el asunto peligroso de Pope, estaremos de acuerdo en que carece de profundidad, o si nos ponemos guapetones le daremos un¨depende¨ filosófico que, en lo personal, me saca la sonrisa, por eso del acoso intenso de manejar la dualidad que aqueja al hombre en temas de ciencia; para ejemplo el más famoso, el caso del valiente que se lanza a utilizar la palabra con ¨V¨ (verdad) y se enfrenta al mencionado acoso. Mucha publicidad se le ha dado a la ¨V¨, pero resulta irónico que entre la lucha de la búsqueda de ésta, al final, se acepte que es un acto de fe personal. El hombre en su condición por naturaleza, busca entre sus recovecos la verdad, que para el caso es la que se le acomoda mejor. Las corrientes a ¨medio cocer¨ hacen referencia al relativismo cultural y, enfrenta a la búsqueda de ajuste ¨justo¨ entre la objetividad de toda verdad con el potencial de ser absoluta, más no necesariamente moldeada a toda ideología. Hace falta tomar como argumento y crítica a los moldes que terminaron sexando los métodos para encontrar las ¨verdades¨, así después hay que pensar en el valor objetivo que tiene eso.

Mostradme un relativista cultural a 90.000 metros de altura y os mostraré un hipócrita…¨ Los ríos del Edén

¨La física moderna nos enseña que en la verdad hay más de lo que el ojo puede ver. Ante otros misterios profundos y sublimes, la vil cháchara intelectual de los pseudo-filósofos presuntuosos no parece digna de la atención de un adulto¨.

Algunos preferimos mirar hacia otro lado si esto se pone feo. Buscar un lugar seguro cuando el mundo gira en un sentido absurdo; pero he aquí la distinción entre el refugio enfermizo o el que muestra el camino que realmente nos dote de libertad, que nos conceda la ventana al entendimiento y nos invite a crear ideas; sin ser un método controlador basado en el miedo o en la ¨peligrosidad¨. El conocimiento no representa en ningún momento un peligro, uno pensaría que en estos tiempos no haría falta decirlo, pero tristemente no es así. Resulta insultante que se refieran al científico como un ente peligroso y, que como estudiantes, nos enfrentemos a una barrera cultural que dificulte el apoyo hacía la búsqueda de producir y divulgar el conocimiento. Si acaso baso mi vida en la irrealidad y digo que el fracaso planeo sobre el pensador, caeré peligrosamente en la suciedad y entonces tendré miedo de mi porque entonces sí, como dijo García Márquez, la sabiduría nos llega cuando ya no nos sirve de nada.

En la investigación sobre percepción pública de la ciencia y la tecnología, se concluye que los mexicanos confían “demasiado en la fe y muy poco en la ciencia”. “Ignorancia” en materia de ciencia refleja fallas educativas, alerta senador. El Universal

A decir verdad es bastante obvio que el sentimiento general hacia la ciencia, en particular, está fomentado por la falsa mejora educativa. El ¨vasto¨ conocimiento al que las actuales generaciones hemos tenido acceso está estrictamente controlado, no abarcando ni lo más básico en las asignaturas. Apoyo la idea de evitar que la presentación educativa de la ciencia y la tecnología se limiten a formatos en los que los conocimientos científicos parezcan hallazgos o descubrimientos al margen de condicionantes históricas e ideológicas, como heroicos logros de genios individuales.

Y así, la peligrosidad no llena mis zapatos. Me gustaría compartir este extracto ahora

¨…Echó un vistazo a las notas que había estado escribiendo y eso puso en marcha su mente. Se sentó a mi lado para leerlas más atentamente. Trataba sobre el desarrollo metalúrgico y él comenzó a hablarme del descubrimiento y del valor del descubrimiento, de los incesantes esfuerzos de los hombres por obtener más conocimiento y más poder, del significado de este deseo de saber y hacer y de lo que nosotros, en la escuela, estábamos haciendo en ese proceso. Conversamos, él habló por cerca de una hora en aquella aún nocturna habitación. Fue una de las horas más extraordinarias, más formativas de mi vida…¨ La dicha de vivir peligrosamente: Sanderson de Oundle. En el capellán del diablo.