domingo, 13 de noviembre de 2011

Reseña-comentario sobre Hedónico fragmentario, de Hugo Medina.


Desde partículas subatómicas hasta el funcionamiento neuronal, Hedónico fragmentario se construye a partir de tópicos que reflejan la visión de un artista perplejo ante la fascinación y la compulsión por conciliar disciplinas consideradas antípodas. Esta representación de hombre bisagra unifica campos fundamentales del intelecto humano, como la ciencia y filosofía, en un ejercicio que nos recuerda que los opuestos se conjugan para generar una visión, además de lúcida, poética.

En un principio, el autor parte de una revisión histórica de la cosmología que concluye que simples y pequeñas estructuras pueden explicar el comportamiento de grandes sistemas como el universo mismo. Sin embargo, una breve introducción a la física cuántica y los procesos entrópicos, nos lleva a reflexionar sobre la fragilidad que experimenta un habitante a 27.700 años luz de distancia de un centro galáctico del cual no sabe nada, salvo que existe. Las teorías científicas expuestas concuerdan en que el surgimiento de la vida es un proceso de transición en el cual es posible sortear obstáculos para materializar la existencia, aun cuando se abandona la dependencia de una conciencia absoluta de creación.

En este singular viaje que parte de una exposición breve y concisa sobre flujos energéticos, informática y ADN, división, diferenciación, muerte inducida e inmortalidad a nivel celular, entre otros, Hugo Medina advierte las dificultades de interactuar con una mente humana empeñada en la sistematización y orden, capaz de transformar inclusive el mundo físico. Esta dificultad es expuesta de forma que nos permite reflexionar sobre cómo la raíz escéptica es alimentada por el carácter paradójico de las ciencias fácticas. Para ejemplo, el conocimiento actual sobre las rutas y reguladores metabólicos que en conjunto predisponen, entre otros, la conducta, el placer y los deseos han iluminado el enigmático misterio de la conciencia. Sin embargo, se intuye también que, en su capricho de existir, son los enigmas biológicos los que juegan con las leyes físicas y químicas, limitándose su estudio a cumplir un propósito falsable con modelajes e hipótesis logrando ser, en ocasiones, más que una aproximación.

Ante todo, este libro es un compendio muy original que sin duda vale la pena leer.

domingo, 17 de julio de 2011

Letter from Darwin to Asa Gray


With respect to the theological view of the question. This is always painful to me. I am bewildered. I had no intention to write atheistically. But I own that I cannot see as plainly as others do, and as I should wish to do, evidence of design and beneficence on all side of us. There seems to me too much misery in the world... On the other hand, I cannot anyhow be contented to view this wonderful universe, and especially the nature of man, and to conclude that everything is the result of brute force. I am inclined to look at everything as resulting from designed laws, with the details, whether good or bad, left to the working out of what we may call chance. Not that this notion at all satisfies me. I feel most deeply that the whole subject is too profound for the human intellect. A dog might as well speculate on the mind of Newton.


Charles Darwin, when Asa Gray ask him that natural selection could be a mechanism for intelligent design, extract from the book "Rock of Ages" from Stephen Jay Gould.

martes, 5 de abril de 2011

Mi fe personal


Si podemos imaginar que existe un estado de cosas muy peligrosas sabremos que, de todo lo pensado no tenemos conclusión o solución. Los paraísos cuentan anécdotas en las que suelen verse compensadas vaguedades en detalles por brillantez y, la moraleja se reduce a una simple palabra: P r u d e n c i a. Esta cuestión ha sido ligada a la ciencia o, si me lo permiten, a la mitociencia. En el barril de las excusas tenemos un sin fin de gloriosas vaguedades que tienen la cualidad de embonar bien en el molde irracional; La escéptica atmósfera del laboratorio científico no tiene ninguna función conducente para las sensibles fuerzas involucradas. Criminales o fanáticos de la objetividad, las verdades a nivel humano que no se prestan a las pruebas científicas en ocasiones tan simples como ensayos de doble ciego, por ejemplo, son el contraataque obvio e inmediato del coraje intelectual. Las verdades, justo como se pueden leer en Alan Sokal y otros filósofos de los que apenas tengo idea, ponen al científico en el ya mencionado alguna vez, acoso filosófico. Según algunos, al afirmar que el método científico, incluyendo matemáticas y lógica, es una vía privilegiada hacia la verdad se está llevando a cabo en ello un acto de fe personal; por lo tanto nuestra fe personal es la que curiosamente nos lleva a elegir nuestra clase de verdad, una verdad que bien puede ser modificada o sustituida por otra ¿Otro contraataque al coraje intelectual? Estoy de acuerdo en que los cambios basados en los méritos son raros, lo digo fácil pues mi sistema de creencia no está plantado en uno de lealtad particular, pero puedo decir que la comunidad obsesiva de ¨búsqueda de la verdad¨,puede estar segura de que su propósitos sea falseable y, orgullosa de, en ocasiones, más que una aproximación. Esta última cuestión es nuestra salvación contra el ilustrado Popper y uno que otro popperiano, pues sus posturas parecen estar más basadas en las curiosas ¨verdades¨ de Newton y Einstein, caso en el que es bastante aceptable que estas no sean otra cosa más aproximaciones. No hay verdad absoluta. Tus verdades científicas son meras hipótesis que hasta el momento han podido ser refutadas, pero que están destinadas a ser reemplazadas por otras. En el peor de los casos, tras la próxima revolución científica, las verdades de hoy parecerán pintorescas y absurdas, si no directamente falsas.¨ Thomas Kuhn.

Frenéticos de sentido podemos notar, o no, que esto tiene uno muy curiosos e interesante; todas nuestras percepciones sensoriales pueden ser consideradas, como hipótesis acerca del mundo que bien pueden ser vulnerables al cambio, pero, tal vez y sólo tal vez, una línea del pensamiento que nos lleve a imaginar nuestras percepciones como modelos hipotéticos puede llegar a perderse entre la línea de la realidad y la ilusión, a menos que nuestra línea tenga una raíz escéptica en la realidad.Aun cuando nominalmente se trata de hipótesis bajo palabra, estas afirmaciones son verdaderas exactamente en el mismo sentido en que es verdad que el lector posee una cabeza y que mi escritorio es de madera. Si las verdades científicas son vulnerables a la duda filosófica, no lo son más que las verdades de sentido comúnRichard Dawkins como siempre proclama justicia en nuestras objeciones filosóficas. La sentencia contra la que la ciencia, bien hecha, se enfrenta es la inclinación por lo anecdótico, particular y personal. Las ilusiones pueden o no ser más fuertes que la estadística, y cuando está nos muestra lo contrario a lo ¨idealizado¨ no nos gusta, no funciona. Vemos caras en las nueves, imágenes divinas en tortillas y panes, la fortuna en las hojas de té y un gran etcétera, pero, como decía John Diamond: La mente humana debe aprender a desconfiar de su innata tendencia a salirse con la suya y ver patrones allí donde sólo hay azar. Qué cada quién deposite su confianza y sus deseos – o su fe personal- donde le parezca correcto o vagamente coherente.

viernes, 4 de marzo de 2011

Del diseño a la RuBisco


En el mundo del pensamiento complejo, aceptar que el genoma humano es, por mucho, menor que el de una planta, es un paso para derrocar los males de la humanidad. ¿Qué tan importante es considerar las características enigmáticas que encierra la naturaleza? ¨Si un chango aprende a decir depende, automáticamente es un biólogo¨, y habiendo tanto chango intelectual, el requisito no termina de cumplirse. El enigmático mundo biológico, juguetea con las leyes físicas y químicas, ajustándolas al ¨capricho¨ de existir. Sin tratar de extenderme en la cuestión, para mis propios fines educativos desecharé de mi vocabulario cualquier afinidad con el término que sugiere un arreglo intelectual, a no ser por las propias manos del hombre en la construcción inteligente para todo un mundo de posibilidades tecnológicas. El límite que justifica nuestros ataques contra el relojero o director de orquesta está inflándose de ideas que abusan de las características propias del no sentido estricto. Existen grandes muchos ejemplos de los ¨fallos¨ del diseño inteligente que erróneamente defiende la tendencia hacía una mejora, y es indiscutible que negar el determinismo puntual y otras imposturas sean tan incorrectas como correctas. Los extremos, bien decía mi abuela, no son buenos y estos han abusado considerablemente en todo intento por darle un carácter de molde a la ciencia. Tras mi última práctica de laboratorio en la semana, recordé las inmortales palabras de nuestra maestra de fisiología vegetal, en la que tras su característica excitación por el tema, mencionó que si existía Dios, seguramente era la Rubisco. La importancia colosal de la Rubisco es que es la proteína más abundante de todo nuestro planeta y el primer paso para la fotosíntesis en la gran mayoría de las plantas (C3 y C4). La enzima rubisco tiene dos actividades paralelas: la carboxilación y por otro lado la oxigenación de la ribulosa-1,5- bifosfato (RuBP). Esta competencia de afinidad, es la razón por la cual algunos aseguran que es un válido ejemplo de ¨fallo¨en la naturaleza. A mediados del siglo XX, Melvin Calvin (Nobel de Química en 1961), describió la ruta por la cual la energía química en forma de ATP y NADPH, conseguida a partir de la energía lumínica, se utiliza, entre otros procesos, para fijar el Carbono procedente del CO2 atmosférico en compuestos orgánicos. Y es aquí donde la protagonista es nuestra Rubisco. En la competencia por afinidad, la fijación del oxígeno se entiende, malamente, como un desperdicio de energía, (la fotorrespiración).

La fotorrespiración es un error, un fallo, las plantas la realizan sin quererlo. El fallo por lo tanto es la baja selectividad de la RuBisCo que le permite reaccionar tanto con el CO2 como con el O2, cuando lo ideal sería que sólo reaccionara con el CO2. En una situación típica, la fotorrespiración reduce la eficiencia del proceso a un 70%. Para los biólogos, acostumbrados a mecanismos de regulación prácticamente perfectos, esta eficiencia tan baja es totalmente anormal, y es por eso que se considera un probable fallo en la evolución.

Afirmar que la Rubisco es un buen ejemplo de fallo en el diseño, es una aseveración que bien debería anularse. Las condiciones en las que se originó la Rubisco, ciertamente eran distintas a las que existen en la actualidad, motivo por el cual, la idea de un simple fallo del diseñador ¨perfecto¨, es un error. La baja eficiencia no representa una cuestión anormal para un biólogo, pues los procesos que considera la evolución no ven a futuro, pues no toda evolución es adaptativa, ni toda adaptación representa evolución. La función de la fotorrespiración aún es desconocida, se piensa que podría ser útil en condiciones de intensa luz y bajas concentraciones de CO2 debidas al cierre estomático persistente, causado por estrés hídrico. También se cree que podría tener un papel importante en la prevención de la fotooxidación y la fotoinhibición.

La única mano de obra ¨inteligente¨ es la mano del hombre en su afán por regular la naturaleza, ¨…su fracaso en adaptarse de manera significativa a la atmósfera moderna limita la productividad agrícola.¨ John Ellis, Nature.

Las ¨fallas¨ están en función de la utilidad, pero, el depende determina la efectividad significativa; Entre las curiosidades de Rubisco, Griffiths, encontró que , a una temperatura de 25ºC en una solución en la que hay 25 veces más oxígeno que dióxido de carbono, Rubisco fija más dióxido de carbono, y tan sólo el 25% de las reacciones son sucesos de oxigenasa, además los carbonos perdidos por la acción de oxigenasa, son metabolizados y recuperados por la ruta de fotorrespiración. La baja eficiencia que representa la Rubisco es compensado con su cantidad, que representa aproximadamente el 50% de proteína soluble en la hoja. La oxigenación evita la fijación de CO2 y disminuye el rendimiento de la fotosíntesis, pero parte del CO2 perdido se recupera por el mecanismo de la fotorrespiración. Se debate que la posibilidad de que pueda haber una adaptación casi óptima a los medios gaseosos y térmicos, prueba de ello, las modificaciones de las rutas en las plantas condicionadas a ambientes difíciles.

La crítica al verdadero diseño inteligente:

El mayor de los misterios es por qué personas invierten tanta energía intelectual tratando de mejorar esta extraordinaria molécula. Pueden vivir con el pensamiento de que la Rubisco es un soberbio ejemplo de un diseño sin inteligencia para el mundo moderno. Tacking unintelligent designin.